Japonia se află la intersecția a două zone climatice – subtropicală în sud și temperată în nord.
Tara poate fi vizitată pe tot parcursul anului, însă este bine de știut că verile sunt fierbinți, iar între lunile iunie și august pot apărea taifunuri. Iernile sunt blânde și umede.
Mulți călători aleg să viziteze Japonia primăvara, pentru spectacolul florilor de cireș, sau toamna, după încheierea sezonului taifunurilor, când peisajul se îmbracă în nuanțe superbe de arămiu, galben și roșu.